ソナーキット入手後に船の墓場ヤードでバキータと話すと行けるようになります。
全てクリア後にバキータと話してパーティアイテム「Ex.ファイルキー」を入手する。

パズルボックス01(X:18898 Y:10030)
消費アイテム 「ポーションベリー」×3
パズルボックス02(X:17201 Y:11081)
スキル「忘却耐性2」
パズルボックス03(X:7502 Y:6232)
スキル「雷属性耐性2」
パズルボックス04(X:6500 Y:18381)
10000ギャラ
パズルボックス05(X:18901 Y:19630)
スキル「FPアドバンテージ」
パズルボックス06(X:22509 Y:14433)
消費アイテム「リヴァイブフルーツ」×5
パズルボックス07(X:22008 Y:3031)
パーティアイテム「フォーミュラーカット」
パズルボックス08(X:14653 Y:22437)
スキル「闇属性耐性2」
パズルボックス09(X:10300 Y:17633)
消費アイテム「フォースキャロット」×3
パズルボックス10(X:13501 Y:831)
パーティアイテム「パーツチェッカー」
パズルボックス11(X:8900 Y:14930)
消費アイテム「ネクタール」×5
パズルボックス12(X:6000 Y:8632)
消費アイテム「レベルアップル」
パズルボックス13(X:3798 Y:4282)
パーティアイテム「マイグラントバッジ」
パズルボックス14(X:21601 Y:9231)
スキル「やるせない耐性3」
パズルボックス15(X:21932 Y:17134)
消費アイテム「1ギミルコイン」×10
パズルボックス16(X:8300 Y:5633)
イベントアイテム「四人の魔女 第六章」
パズルボックス17(X:17900 Y:24322)
消費アイテム「ミラクルベリー」×3
パズルボックス18(X:3400 Y:1133)
20000ギャラ
パズルボックス19(X:2001 Y:23583)
スキル「混乱耐性3」
パズルボックス20(X:19404 Y:12534)
スキル「サポートアタック」
パズルボックス21(X:13599 Y:20132)
消費アイテム「ラッキーカード」×5
パズルボックス22(X:22704 Y:4431)
パーティアイテム「ゲージリペアキット」
パズルボックス23(X:12300 Y:21932)
パーティアイテム「アルターパーツ」×4
パズルボックス24(X:12099 Y:19932)
30000ギャラ
パズルボックス25(X:3100 Y:3531)
消費アイテム「アンブロシア」×3
パズルボックス26(X:8500 Y:16132)
スキル「忘却耐性4」
パズルボックス27(X:13701 Y:12332)
イベントアイテム「四人の魔女 第八章」
パズルボックス28(X:24850 Y:11183)
イベントアイテム「ブラックパス」
パズルボックス29(X:20000 Y:16031)
スキル「戦闘不能耐性4」
パズルボックス30(X:5600 Y:16583)
スキル「MPリペア」